Het museum van de onschuld is het verhaal van de liefde van de rijke zakenman Kemal voor Füsun, een ver familielid dat veel jonger is dan hij. De liefde wordt zorgvuldig gedocumenteerd door middel van allerlei voorwerpen die met Füsun te maken hebben. De lezer wordt door een museum geleid waar de voorwerpen tentoongesteld zijn, en het verhaal ontvouwt zich aan de hand daarvan. De liefde brengt Kemal in alle uithoeken en in de meest uiteenlopende kringen van Istanbul.